仙剑的故事之所以能比其它游戏还能够引起玩家的共鸣，就是因为它的故事围绕着一个主旨上，那就是「情」，《仙剑奇侠传》一代的主旨是在于「宿命」，而二代的中心主旨则是「宽恕」，经过这么多年是唯一不曾改变的。所谓的宽恕，不一定是原谅了仇人就叫宽恕，有些是仇恨没错，有些是迷惘，有些则是痴情，而有些是误会，当所有仇恨、迷惘、痴情或误会真相大白、真情流露，使人悟得更深一层的道理，对于世间的人事物其看法或认知有完全不同的理解时，也何尝不是一种宽恕的表现啊！
基本上，二代的故事是在一代故事结束的八年之后，而二代的男主角就是跟李逍遥同一个村子的王小虎，还有李逍遥的女儿李忆如，以及另外两个女主角，四个人交织出一段错综复杂的故事来。当然，也有一些一代的主角以及全新的人物会在二代中出现，准备将前后两代发生过以及即将发生的感情、恩怨等纠葛，作一个完整的交代。
